CCDC (Cambridge Crystallographic Data Centre) - CSD-Materials
CSD-Materials 是 CCDC 提供的一款針對(duì)固態(tài)研究領(lǐng)域的軟件套件，它基于龐大的晶體學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)（Cambridge Structural Database，CSD）進(jìn)行晶體學(xué)性質(zhì)的研究和預(yù)測(cè)。CSD-Materials 主要功能包括：
● 晶體學(xué)性質(zhì)分析：分析晶體結(jié)構(gòu)中的分子構(gòu)象及分子內(nèi)/分子間作用，包括氫鍵、π-π堆積等。
● 水合物/溶劑合物分析：分析水合物/溶劑合物結(jié)構(gòu)及分子間相互作用。
● 共晶預(yù)測(cè)：評(píng)估目標(biāo)分子與一系列配體形成共晶的可能性，以預(yù)測(cè)合適的共晶配體。
● 配位化學(xué)分析：研究金屬配位環(huán)境，對(duì)金屬有機(jī)化合物和金屬配位聚合物等領(lǐng)域具有應(yīng)用價(jià)值。
● 數(shù)據(jù)可視化和報(bào)告：使用Mercury 可視化軟件展示晶體結(jié)構(gòu)，提供高質(zhì)量的圖像和交互式分析。
Avant-garde Materials Simulation (AMS) - GRACE
Avant-gardeMaterials Simulation在過(guò)去幾屆由CCDC組織的晶體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)比賽中皆是最出色的表現(xiàn)者。GRACE 是 AMS 公司開(kāi)發(fā)的一款晶體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)軟件。它結(jié)合了熱力學(xué)、結(jié)構(gòu)和動(dòng)力學(xué)方面的信息，通過(guò)計(jì)算方法預(yù)測(cè)晶體結(jié)構(gòu)。
GRACE 的主要功能包括：
● Global晶體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)：基于熱力學(xué)、結(jié)構(gòu)和動(dòng)力學(xué)信息，預(yù)測(cè)晶體的結(jié)構(gòu)和穩(wěn)定性。
● 優(yōu)化現(xiàn)有晶體結(jié)構(gòu)：通過(guò)能量最小化和結(jié)構(gòu)調(diào)整，優(yōu)化現(xiàn)有晶體結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。
● 能量排序：對(duì)不同晶體結(jié)構(gòu)進(jìn)行能量排序，篩選出熱力學(xué)上最穩(wěn)定的晶型。
● 數(shù)據(jù)可視化：通過(guò) PowderCell 等軟件展示預(yù)測(cè)的晶體結(jié)構(gòu)。
COSMOlogic - COSMOtherm
晶云藥物結(jié)合多年實(shí)驗(yàn)研發(fā)經(jīng)驗(yàn)，運(yùn)用先進(jìn)模擬軟件COSMOlogic提供服務(wù)，提高計(jì)算效率與評(píng)估準(zhǔn)確度，共同助力高效藥物研發(fā)。
COSMOlogic基于COSMO-RS (Conductor-like Screening Model - Real Solvents)和量子力學(xué)預(yù)測(cè)任意組份混合溶液的熱力學(xué)性質(zhì)，其基于量子化學(xué)計(jì)算的結(jié)果快速準(zhǔn)確。在醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域適用范圍廣泛，多可用于預(yù)測(cè)多種熱力學(xué)性質(zhì)，如共晶篩選、溶解度、分配系數(shù)、pKa、活度系數(shù)、蒸氣壓等。
COSMOlogic的 COSMOtherm軟件套件主要用于預(yù)測(cè)和計(jì)算物質(zhì)間的相互作用和熱力學(xué)性質(zhì)，特別是在液相和氣相領(lǐng)域，主要功能包括：
● 共晶預(yù)測(cè)：預(yù)測(cè)共晶系統(tǒng)的組成和熱力學(xué)穩(wěn)定性，對(duì)藥物共晶研究具有重要意義。
● 水合物/溶劑合物預(yù)測(cè)：預(yù)測(cè)和評(píng)估水合物/溶劑合物的形成風(fēng)險(xiǎn)。
● 相平衡計(jì)算：計(jì)算不同物質(zhì)之間的相平衡，如氣液平衡、液液平衡和固液平衡，以便了解混合物的穩(wěn)定性和相行為。
● 溶解度預(yù)測(cè)：預(yù)測(cè)化合物在不同溶劑中的溶解度，對(duì)藥物、顏料、涂料等領(lǐng)域具有應(yīng)用價(jià)值。
● 化學(xué)反應(yīng)熱力學(xué)性質(zhì)預(yù)測(cè)：預(yù)測(cè)化學(xué)反應(yīng)的平衡常數(shù)、酸解離常數(shù)等，對(duì)化學(xué)過(guò)程設(shè)計(jì)和優(yōu)化有重要價(jià)值。
● 吸附性質(zhì)預(yù)測(cè)：預(yù)測(cè)吸附劑對(duì)不同物質(zhì)的吸附性能，對(duì)環(huán)境保護(hù)和分離技術(shù)有重要意義。
我們提供的服務(wù)包括：
● 共晶篩選。
● 溶解度預(yù)測(cè)。
共晶篩選 | 溶解度預(yù)測(cè) |
我們基于COSMOlogic的虛擬共晶篩選功能，輔助研發(fā)人員，提高共晶篩選效率。通過(guò)對(duì)候選化合物API分子和數(shù)據(jù)庫(kù)中的大量配體分子進(jìn)行配對(duì)計(jì)算，根據(jù)其過(guò)剩焓等性質(zhì)進(jìn)行排序，用以評(píng)估API和配體形成共晶的可能性。
形成共晶可以有效調(diào)控藥物分子的溶解度、溶出速率、滲透性、引濕性、化學(xué)穩(wěn)定性等關(guān)鍵性質(zhì)。在機(jī)械性質(zhì)改善、味道掩蔽、乃至延長(zhǎng)專利保護(hù)期方面，共晶同樣可以發(fā)揮作用。尤為重要的是，共晶中不同組分間通過(guò)氫鍵、范德華力、π-π相互作用等非離子力相互作用，為大量難以成鹽的中性候選化合物分子打開(kāi)了性質(zhì)改善的大門。
| 通過(guò)對(duì)化合物API和雜質(zhì)在大量溶劑和多元溶劑組合中的溶解度預(yù)測(cè)，我們使用COSMOlogic選擇合適的溶劑體系進(jìn)行雜質(zhì)分離；不同溫度和溶劑配比下的溶解度預(yù)測(cè)，也可以指導(dǎo)結(jié)晶溶劑的選擇，為結(jié)晶工藝開(kāi)發(fā)提出建議。
化合物在不同溶劑中的溶解度影響著反應(yīng)、分離、提純、結(jié)晶等多個(gè)過(guò)程的效果。 |